厚生労働省の賃金構造基本統計調査等のデータによると、臨床工学技士の平均年収相場は400万〜550万円前後（平均年齢30代半ば〜40代前半）で推移しています。夜勤・オンコール手当や当直回数、所属施設の規模（国公立・大学病院・民間法人）によって大きな格差が生じているのが現状です。
近年、技士会が注力している「認定臨床工学技士」や「専門臨床工学技士」（血液浄化、不整脈治療、体外循環、呼吸治療、高気圧酸素、手術室など各特定分野）の資格制度は、個人の市場価値を証明する強力な武器となっています。病院機能評価や施設基準において特定資格の保有者が要件化されるケースが増加しており、資格取得者に対して月額5,000円〜20,000円程度の資格手当を支給する医療機関も着実に増えています。
昇給カーブが頭打ちになりやすい臨床工学技士のキャリアにおいて、技士会の教育プログラムを活用して上位専門資格を取得し、部署の主任・技士長クラスへ昇格する、あるいは待遇の良い大規模総合病院へ転職することは、年収600万円以上の高水準へ到達するための極めて現実的なステップといえます。
