セ・パ両リーグにおける最大の競技上の違いは、DH制（Designated Hitter＝指名打者制）の採用有無です。
パ・リーグは1975年にDH制を導入しました。投手の代わりに打撃専門の選手が打席に入るため、打線に切れ目がなくなり、得点力や迫力ある空中戦が増加します。対するセ・リーグは伝統的なスタイルを維持し、投手も9人目の野手として打席に立ちます。これにより、セ・リーグでは投手をいつ代打と交代させるか、送りバントをどう使うかといった「采配の駆け引き」が重視される傾向にあります。
また、試合前日に翌日の先発投手をファンやメディアに公表する「予告先発ルール」も、かつては違いの一つでした。パ・リーグがファンサービス向上を目的に1994年から導入した一方、セ・リーグは情報戦を重んじる観点から長年見送っていましたが、2012年シーズンよりセ・リーグでも正式採用され、現在は両リーグ共通のルールとなっています。
