睡眠医学の第一人者である医師の遠藤拓郎氏は、現代人の不眠傾向について「体内時計と実際の生活スケジュールの乖離」を指摘する。就寝前の強い光刺激や不規則な食生活は、本来の睡眠バイオリズムを大きく揺さぶる。体温が最も下がる時間帯が前倒しになると、明け方に身体が『もう朝だ』と勘違いを起こすのだ。
また、国立精神・神経医療研究センターの研究機関が実施した臨床調査でも、睡眠の質が低下している層ほど、明け方に深い睡眠(ノンレム睡眠)を維持できず、わずかな環境変化で中途覚醒や早朝覚醒を起こしやすいことが実証されている。脳の休息深度が浅いことこそが、フライング起床の直接的な引き金となっている。