まんだらけ渋谷店の最大の強みは、地下2階の広大なワンフロアにあらゆるジャンルのコレクターズアイテムが隙間なく敷き詰められている点にあります。通路ごとにテーマが明確に分かれており、一歩足を踏み入れるごとに異なる時代のカルチャーが押し寄せてきます。
エントランス付近から中央にかけて広がるTOYコーナーでは、ソフビ・レトロ玩具の圧倒的なショーケースが視界を奪います。マルサンやブルマァクをはじめとする昭和40年代の当時モノ怪獣ソフビから、近年のインディーズソフビ、超合金、変身ベルト、ブリキ玩具まで、国内外のバイヤー垂涎の逸品が厳重にディスプレイされています。海外からの渡航者によるインバウンド需要も高く、日々貴重なヴィンテージトイが売買されています。
書籍エリアでは、ヴィンテージコミックや絶版漫画の棚が壁一面を埋め尽くしています。昭和の貸本劇画、黎明期の少女漫画誌、初版帯付きの少年ジャンプコミックスなど、国会図書館でも閲覧が難しいレベルの歴史的資料が実物として並びます。状態に応じた細かな価格設定がなされており、コンディションにこだわるコレクターも納得の品揃えです。
さらに渋谷店を特徴づけるのが、女性同人誌やアイドルグッズの圧倒的な物量です。アニメ・ゲーム系のBL同人誌や二次創作アンソロジーはもちろん、昭和・平成の男性アイドル、ジャニーズ系、K-POP関連の公式グッズ、生写真、ツアーパンフレット、さらには昭和歌謡期のアイドル写真集まで網羅。渋谷という土地柄に合わせ、流行の最先端とノスタルジーが共存する独自の商品構成が維持されています。