静岡県立駿河総合高等学校の成り立ちを理解する上で外せないのが、静岡南高校と静岡市立商業高校の合併という歴史的背景です。静岡県教育委員会の再編計画に基づき、普通教育に強みを持っていた県立静岡南高校と、実業教育で数多くの商業人材を輩出してきた静岡市立商業高校が統合し、2013年4月に静岡市駿河区有東の地（旧静岡南高校跡地）に開校しました。
この統合がもたらした最大の遺産が、現在も学校の根幹を支える「総合学科」システムです。1年次には必修科目とキャリアガイダンス科目である「産業社会と人間」を通じて、自らの適性と将来の進路を徹底的に見つめ直します。そして2年次以降、生徒は自らの希望に合わせて「駿河総合の総合学科の系列」から科目を選択し、時間割をオーダーメイドで組み立てていきます。
用意されている系列は多岐にわたり、大学進学を視野に入れた「人文・社会」「自然・情報」から、実社会で直結するスキルを養う「ビジネス・マネジメント」「情報・デザイン」、さらに少子高齢化社会のニーズを捉えた「生活・福祉」、身体能力と健康科学を深める「健康・スポーツ」など、普通科高校と商業・実業系高校の長所がハイブリッドで組み合わされています。普通科のような一律の進学対策ではなく、自分の得意不得意に合わせた学びが可能な点が、今なお中学生から高い支持を集める決定的な理由です。
