東部医療センターの歴史において最大の転換点となったのが、2026年4月に実施された名古屋市立大学（名市大）への統合です。旧「名古屋市立東部医療センター」は長年、名古屋市東部エリアの地域中核病院として市民医療を支えてきましたが、医療の高度化・複雑化に対応するため、大学病院群の一翼を担う教育・研究・高度臨床機関へと再編されました。
この統合経緯の背景には、医師確保の安定化と先進医療の積極的導入という明確な狙いがあります。名市大医学部の医局と直結したことで、各診療科に専門医や指導医が潤沢に配置され、がんゲノム医療や高度心血管カテーテル治療、低侵襲手術（内視鏡・腹腔鏡手術）などの受け入れ体制が格段に充実しました。
単なる名称変更にとどまらず、同じく名市大附属となった西部医療センターやみずほ通の本院（名市大病院）との間で診療機能の役割分担と連携が確立。東部医療センターは特に「高度急性期医療」「救急医療」「周産期・小児医療」の要としてのポジションを確立し、東名古屋エリアにおける最後の砦としての機能を盤石なものにしています。
