一般的に「黒目」と表現される日本人の瞳だが、厳密な解剖学の領域において純粋な「黒色」の虹彩は存在しない。瞳の色を決定づけているのは、虹彩基質に存在するメラニン色素の量とその配置だ。
メラニンには黒から褐色を呈するユーメラニン(真性メラニン)と、赤から黄色を呈するフェオメラニンが存在する。日本人の多くはユーメラニンを高濃度で保有しているため、一見すると黒っぽく見えるが、強い光を当てると緻密に織り込まれた茶色の繊維構造が浮かび上がる。2026年の最先端光学顕微鏡を用いた研究によれば、この色素配列のパターンは指紋と同様に世界中で誰一人として同じものが存在しないという。