舞鶴海上保安学校の採用試験は、国家公務員高卒者試験と同等レベルに位置づけられています。一般的な大学受験の模試に換算すると、舞鶴海上保安学校の偏差値は50〜55程度がひとつの目安です。ただし、学科試験の難問を解く力だけでなく、体力検査や人物評価（面接）、さらには厳格な身体検査をすべてクリアしなければならない点が、通常の大学入試と大きく異なります。
直近の海上保安学校の倍率と難易度を見ると、全体平均でおよそ2.5倍から4.5倍程度を推移しています。ただし、志望する課程によって難易度の開きが大きいのが実情です。巡視船艇の要員を育てる「船舶運航システム課程」が2〜3倍台で比較的安定しているのに対し、パイロットを養成する「航空課程」は募集枠が極めて少なく、倍率が10倍前後の高水準に跳ね上がる年もあります。
あわせて比較されるのが、広島県呉市にある「海上保安大学校」との関係です。海上保安学校と海上保安大学校の違いは、将来のキャリアパスと修業年限にあります。大学校は4年半かけて幹部海上保安官（キャリア組）を養成する大卒相当の教育機関（偏差値60以上）であるのに対し、学校は1年または2年で現場のスペシャリスト（即戦力）を育てる機関です。どちらが優れているかではなく、現場でいち早く船艇や航空機に乗りたいのか、将来的に組織の舵取りを担う幹部を目指すのかという志向の違いで選ばれています。
