かつて経鼻内視鏡が登場した初期は、「鼻用カメラは細いため画質が粗く、小さな病変を見落としやすい」と指摘されていました。しかし、CMOSセンサーの超小型化や高精細ハイビジョン（HD）技術の導入が進んだ現在、通常観察における病変の早期発見精度において、経鼻と経口の差は実質的にほぼ解消されています。
粘膜表面の微細な毛細血管や構造を強調するNBI（狭帯域光観察）やBLIといった画像強調技術は、現在の最新経鼻スコープにも標準搭載されています。これにより、早期の胃がんや食道がん、十二指腸ポリープの発見率は極めて高い水準を維持しています。
ただし、専門的な精密検査や治療を視野に入れた場合、依然として経口内視鏡に軍配が上がる場面があります。スコープ先端の処置具挿入口（鉗子口）のサイズ差です。経口スコープは鉗子口が大きく吸引力や送水力が高いため、胃内に溜まった粘液を素早く洗い流す洗浄能力に優れています。また、組織を一部採取する「生検」を行う際、大きな組織片を正確に採取したり、出血時に迅速な止血処置を施したりする操作性においては、太径の経口内視鏡が優位性を保っています。
