長崎で晒された後の天草四郎の首や、原城に残された胴体はどのように葬られたのでしょうか。凄惨な刑の後、その遺骸は各地に分散して埋葬されたと伝えられており、現在も九州各地に首塚や胴塚が残されています。
長崎市内の寺院や勝海舟の記録にまつわる地など諸説ありますが、晒し場となった長崎の地で手厚く葬られたとする伝承が残る一方で、四郎の生まれ故郷である熊本県上天草市（大矢野町）などには「天草四郎の胴塚」が存在します。原城跡に残された遺体を密かに天草へ持ち帰り、供養のために埋葬したと語り継がれています。
また、南島原市の原城跡本丸にも「天草四郎の墓碑」が静かに佇んでいます。幕府によって徹底的に破壊された城跡の片隅に、後世の地元住民や信徒の手によって建てられたものです。首と胴体が引き裂かれてもなお、四郎の魂を慰めようとした民衆の祈りが、現在の天草・島原の地景に色濃く刻まれています。
