撥水スプレーの取り扱いにおいて、絶対に軽視してはならないのが人体への健康被害です。独立行政法人製品評価技術基盤機構（NITE）や厚生労働省は、撥水スプレーの吸入による重篤な呼吸器障害事故について、毎年のように厳しい注意喚起を行っています。
事故の主因となるのは、フッ素樹脂をエアゾール缶で噴霧した際に生じる微細なミストです。この微粒子を吸い込んでしまうと、肺の奥深くに存在する「肺胞」の表面活性物質（サーファクタント）がフッ素の撥水被膜によって不活性化されてしまいます。その結果、肺胞が酸素を取り込めなくなり、激しい咳き込み、呼吸困難、発熱、さらには急性呼吸促迫症候群（ARDS）を引き起こして緊急搬送される事態へと発展します。
「玄関のドアを少し開けていたから大丈夫」「スキー場のロッカー室や更衣室でサッと吹きかけた」という安易な過信が最も危険です。密閉された屋内はもちろん、マンションの風通しの悪い廊下や階段、自家用車の車内での使用は絶対に禁忌です。
安全を担保するためのルールは極めてシンプルです。
- 必ず四方が開けた完全な屋外で使用する（風通しの良い公園や広い庭など）。
- 風向きを常に確認し、必ず風上に立って噴射する。風に乗ったミストが自分や周囲の人、ペットの顔にかからない配慮を徹底する。
- マスク（できれば防塵・防毒対応、最低でも密着性の高い不織布）を着用する。
- 室内でメンテナンスを行いたい場合は、ガス圧噴霧のエアゾール缶を避け、ニクワックスのようなポンプトリガー式（液体ミスト）や洗濯機つけ置きタイプ（ウォッシュイン）を選択する。
