ファンの間やネット検索でしばしば浮上するのが「三味線屋勇次は死亡したのか？」という疑問です。必殺シリーズでは多くの仕事人が凄惨な最期を遂げて退場していったため、勇次の結末についても記憶の混同が見られます。
結論から言えば、テレビ本編の連続ドラマにおいて勇次は死亡していません。『必殺仕事人IV』の最終回（第43話）では、激化する裏稼業の包囲網や自身の境遇を精算すべく、江戸を去る形で旅立ちを選びました。主水や秀と静かに別れを告げ、闇の中に消えていく幕引きは、命を落とす以上の余韻をファンの心に残しました。
後年に制作されたオリジナルビデオ作品『新・三味線屋勇次』や特別編などでも単独の主人公として復活を果たしており、勇次は過酷な掟が支配する必殺世界を生き抜いた、数少ない伝説の仕事人の一人として位置づけられています。
