この建物を唯一無二の存在に仕立て上げているのが、世界的な建築家である伊東豊雄氏が手がけた独創的な空間設計だ。岐阜県産の東濃ヒノキを織りなすように組み上げた木造大屋根構造建築は、一歩足を踏み入れた瞬間に森林浴をしているかのような木の芳香と温もりに包まれる。洗練された建築・都市デザインの結晶とも言える構造だ。
特に圧巻なのが、天井から吊り下げられた大きなグローブ（傘型天井構造）である。半透明のシェード状になったこのグローブが館内各所に柔らかな自然光を均一に拡散させ、同時に空気の自然換気を促す空調システムとしての機能も担っている。グローブごとにテーマや本棚の配置が工夫されており、館内を歩くだけで新鮮な発見がある。
