小鳥遊という苗字の発祥地は、現在の和歌山県（旧・紀伊国那賀郡粉河村、現・紀の川市周辺や和歌山市、熊野地方）とされています。歴史を遡ると、信濃国（長野県）の豪族であった「高梨氏」との関わりや、紀州熊野の社家（神社に仕える神職の家系）に端を発するという説が有力視されています。
もともと「高梨」という地名や家名を名乗っていた一族が、神事や文字の選定において、神聖な意味合いや教養を示すために「小鳥遊」の雅な漢字を宛てたのが始まりと伝えられています。中世から近世にかけての社家や神職階層では、漢字の組み合わせに宗教的・文学的な意味を込める風習があり、この知的な試みが後世に受け継がれました。
明治元年の「平民苗字容赦令」および明治8年の「平民苗字必称義務令」によって一般庶民が苗字を登録する際も、この由緒ある表記を守り続けたごく一部の家系が、現代の「小鳥遊家」として存続しています。
