連射コンを使用していると、「連射が止まらなくなった」「連射速度が変わらない」「ボタンを押しても反応しない」といった問題に遭遇することがある。多くのトラブルはハードウェアの不具合ではなく、モード設定の誤解やペアリングの不備に起因する。
連射が止まらない場合は、誤って自動連射ホールド機能がオンになっているケースがほとんどだ。Turboボタンを押しながら該当のボタンを再度押すか、Clearボタンが用意されているモデルであればTurbo+Clearの同時押しで全設定をリセットできる。説明書を紛失した場合は、まずTurboボタン長押しによる全初期化を試してみるとよい。
また、有線・無線接続の切り替え時に連射設定がリセットされる仕様の製品も存在する。特にNintendo Switchでは、本体の「コントローラーとセンサー」設定から持ち方/順番の変更を行い、正しく再認識させることで入力遅延や設定不具合の多くが解消される。