シーズン3を語る上で避けて通れないのが、脚本家の交代劇です。1st・2ndシーズンおよびスペシャルドラマを手掛けた林宏司氏（代表作：『ハゲタカ』『医龍 -Team Medical Dragon-』）から、安達奈緒子氏（代表作：『リッチマン、プアウーマン』『きのう何食べた？』、後のNHK連続テレビ小説『おかえりモネ』）へとバトンが渡されました。
この交代の背景には、主に以下の2つの要因があったと分析されています。
1. 林宏司氏のスケジュールと作風の方向性：
当時、林氏が他局の大型作品や別プロジェクトを抱えていた物理的なスケジュール都合に加え、フジテレビ側が「10年の年月を経て30代を迎えた登場人物たちの私生活や人生の選択」を重点的に描きたいという構想を持っていた点です。
2. 人間ドラマと恋愛要素の強化：
安達奈緒子氏は登場人物の心理の機微や関係性の変化を極めて繊細に描く名手です。医療の緊迫感を軸にしつつも、緋山と患者・緒方（丸山智己）の淡い恋模様や、藤川と冴島の同棲・結婚、藍沢のトロント行きを巡る葛藤など、一人の人間としての等身大の悩みを浮き彫りにする狙いがありました。
放送当時のネット上の評判や感想は、まさに賛否両論が巻き起こる熱狂状態となりました。旧作からのファンからは「以前のような硬派で泥臭い医療ドラマのテンポが薄れ、メロドラマ要素が増えた」という厳しい声が上がった一方、「キャラクターの感情が丁寧に描かれ、一人ひとりの人生に深く感情移入できた」「新フェローの成長劇として現代的で素晴らしい」と絶賛する声も多数寄せられました。結果として高い視聴率を維持し、次世代へバトンを繋ぐ成功作となったのは間違いありません。
