エンタメ要素の陰で、同館は世界レベルの学術研究拠点としての顔を持つ。特にネズミイルカ繁殖研究プロジェクトは、飼育下での繁殖が極めて難解とされる小型鯨類の保全において国際的に高く評価されている。
公益社団法人日本動物園水族館協会（JAZA）とも連携し、北の海における生物多様性の維持に向けた取り組みが着実に進められている。海洋生物学・ネイチャードキュメンタリーの撮影スタッフが幾度も現地を訪れ、その貴重な生態記録をカメラに収めてきた。冷たい海で育まれる命の奇跡は、研究者たちの執念と愛情によって守られているのだ。
