華やかな移籍劇の裏で、制度そのものの構造的な問題点も浮き彫りになっている。日本プロ野球選手会は、選手の移籍の自由を守るため、現行のフリーエージェント制度における取得年数の短縮や人的補償の撤廃、ドラフト指名権を絡めた補償制度への移行を日本野球機構側に強く求め続けている。
選手が自らの汗と結果で勝ち取った権利であるはずの移籍が、過度な制限や補償のプレッシャーによって阻まれてはならないという主張は根強い。球団間の戦力均衡という大義名分と、個人のキャリアを選択する権利の調和。日本球界が直面するこの命題は、いま大きな転換期を迎えている。