K-POPファンが使う「ペン」という呼称の語源は、英語の「fan（ファン）」です。韓国語に固有の伝統的な単語ではなく、英語の外来語表記に由来します。
日本語では英語の「F」音を「ファ行（ファ・フィ・フェ・フォ）」で音写しますが、現代ハングルの標準的な音韻体系には、下唇と上の前歯を摩擦させて発音する唇歯摩擦音「F」が存在しません。そのため、英語の「F」音は原則として激音の「ㅍ（ピウプ＝強い息を伴うP音）」または平音の「ㅂ（ピウプ＝B/P音）」に置き換えられます。
具体的には、「fan」の子音「f」が激音の「ㅍ」に、母音「a」が「ㅐ（エ）」に、末尾の「n」がパッチム「ㄴ（ニウン＝n）」に転写され、ハングル表記で「팬（paen／発音：ペン）」となりました。韓国現地で「fan」を発音した結果がそのまま「ペン」として定着し、K-POPブームとともに日本へ逆輸入されたという歴史的経緯が存在します。
なお、同様の音韻変化の例として、コーヒーの「カフェ（Cafe）」が韓国語で「카페（カペ）」に、「ファイティン（Fighting）」が「파이팅（パイティン）」になる現象と同じ言語学的メカニズムに基づいています。
