八王子学園八王子高等学校の受験を検討する際、最初に直面するのが緻密に細分化されたコース設計です。かつての「特進」「進学」という大枠から進化を遂げ、現在は生徒の志望大学や特性に応じたハイレベルなコース編成が敷かれています。
最も高い学力を誇るのが「東大・医進コース」です。最新の模試データにおける偏差値は68〜69をマークしており、都立トップ校である八王子東高校や立川高校、神奈川県立の相模原高校などの併願先として定着しています。東京大学をはじめとする旧帝国大学や国公立大医学部現役合格を明確に標榜し、0時間目講習や放課後演習がカリキュラムに組み込まれているのが特徴です。
これに次ぐ「特進コース」は偏差値63〜65に位置し、筑波大・横浜国立大・千葉大といった難関国公立大学や、早稲田・慶應義塾・上智・東京理科大の合格ゾーンを狙う設計となっています。部活動との両立を目指す生徒も多く、進学実績のボリュームゾーンを支える基幹クラスといえます。
一方、中堅私立大学を目指す「進学コース」は偏差値54〜56前後。さらに探究学習や総合型選抜・指定校推薦を主眼に置く「リベラルアーツコース」、実技や専門性を磨く「アスリートコース（スポーツ推薦中心）」「アートコース（美術系）」「ミュージックコース（音楽系）」が設置されており、各コースの偏差値は48〜52近辺で推移しています。
高校入試における推薦入試倍率は、例年1.0〜1.2倍前後と比較的落ち着いた数値で推移していますが、注意すべきは「内申基準の厳格さ」です。併願優遇を利用する場合、中3次の5教科内申点で東大・医進なら24/25以上、特進で22/25以上、進学で19/25以上（または9教科34〜36以上）が事実上のボーダーラインとなります。英検や漢検準2級以上の取得による加点制度が設けられているため、早期からの検定対策が合否を左右します。
