大久野島を語る上で避けて通れないのが、昭和初期の負の遺産です。かつて大日本帝国陸軍が毒ガス（イペリットやルイサイト）を製造していたため、当時の軍事機密として「地図から消された島」と呼ばれていました。現在も島内には毒ガス貯蔵庫跡や発電所跡、砲台跡などの近代化産業遺産が点在し、歴史の証人として保存されています。
ここで多くの人が抱く最大の誤解が、「現在のうさぎは戦時中の毒ガス実験に使われていた動物の生き残りではないか」という俗説です。歴史的資料および大久野島毒ガス資料館の記録によれば、敗戦時に実験用のうさぎはすべて殺処分されており、現在の野生化アナウサギと血統的な繋がりは一切ありません。
直接のルーツは1971年に地元竹原市の小学校で飼育されていた8羽のアナウサギが島に放されたことです。瀬戸内海の温暖な気候に加え、島内にイヌやネコといった肉食性の天敵が存在しなかったこと、さらに国民休暇村の整備に伴い芝生や水源が確保されたことで急速に繁殖していきました。
