本丸跡に鎮座する「眞田神社」は、歴代の上田城主(真田氏・仙石氏・松平氏)を御祭神として祀るパワースポットです。徳川軍の猛攻を二度も跳ね返した歴史から、「落ちない城」「不落城」にあやかり、合格祈願や勝負運向上のご利益を求めて全国から参拝者が訪れます。
特に人気を集めているのが、季節の移ろいや祭事ごとに意匠が変わる眞田神社の限定御朱印です。六文銭や結び雁金の家紋があしらわれたデザインや、切り絵を施した豪華な御朱印はコレクターの間でも高く評価されています。境内にある「真田井戸」は、城外の砦へと通じる抜け穴だったという伝説が残されており、真田一族の知恵とロマンを感じられる必見スポットです。
さらに、大ヒットを記録したNHK大河ドラマ『真田丸』の聖地巡礼スポットとしても根強い熱気を保っています。ドラマのオープニング映像にも登場した風格ある石垣や城内の情景を目の当たりにすると、真田幸村(信繁)や父・昌幸が駆け抜けた戦国時代の息吹が鮮明に蘇ってきます。