現在、施設周辺および館内では在日公館セキュリティ更新プロジェクトに基づく最新の保安基準が適用されている。空港以上の警戒態勢が敷かれており、持ち込める所持品には極めて厳しい制約が存在する。
基本的に持ち込みが許可される携帯電話は1台のみ。ノートパソコンやタブレット、大型のバックパック、液体物、刃物類は一切持ち込めない。館内にコインロッカーは設置されていないため、大型の手荷物はあらかじめ溜池山王駅などのコインロッカーに預けておく必要がある。持ち込み不可の荷物を持ってゲートに到達した場合、周辺のコインロッカーを探して走り回る羽目になり、予約時間を過ぎて拒否されるリスクが高い。
