沖縄尚学を率いる比嘉公也監督の指導眼も、新垣の才能を開花させる上で不可欠な要素だった。比嘉監督自身も2006年の選抜優勝投手であり、エースとしての重圧や大会を通じた成長のプロセスを熟知している。
監督は新垣に対し、無理な連投を避けさせたコンディショニング管理を徹底する一方で、マウンド上での自己洞察力を徹底的に鍛え上げた。「自分で自分の投球を分析し、修正できる投手になれ」という教えを守り、新垣はイニング間ごとにキャッチャーと緻密な打合せを重ねる。エースの成長に刺激を受け、野手陣の守備力や走塁の意識も劇的に向上し、チーム全体が全国トップクラスの完成度へと昇華している。