急速な普及の影で、安全性に関する懸念や法的な位置づけを巡る混乱も少なくない。日本国内において、厚生労働省（MHLW）は2026年、「非医薬品リスト」にNMNを追加した。これにより、医薬品的効能効果を直接標榜しない限り、食品・サプリメントとしての合法的な製造および流通が正式に認められている。
臨床研究における安全性の評価はどうだろうか。1日あたり100mgから最大1000mg規模の継続投与試験において、重篤な有害事象は報告されていない。ヒトの体内で極めて高い忍容性を持つことが確認されている。ごく稀に、空腹時の一括大量摂取に伴う軽度の消化器症状（胸やけ、軟便）が見られる程度だ。
むしろ深刻な問題は、急速に拡大するバイオテクノロジー産業（Biotechnology Industry）の周辺に巣食う、粗悪品や詐欺的な製品の横行である。市場に出回る安価な製品の中には、表記された含有量を満たしていないものや、光学異性体である非活性型のα-NMNを混ぜ込んだ低純度の模倣品が紛れ込んでいる。体内で意図した生理作用を得るためには、原料の純度試験（NMRやHPLC分析）を実施し、第三者機関の分析証明書（CoA）を開示している信頼できるメーカーを選ぶリテラシーが消費者に求められる。
