高蔵寺高校の最大の強みは、何と言っても「国公立大学への手厚い合格実績」にあります。春日井市内外の同偏差値帯の高校と比較しても、国公立大学への合格者比率は依然として高い水準を誇ります。
公表されている公式進路データおよび取材によると、毎年100名前後が国公立大学へ合格を果たしています。主な進学先としては、名古屋大学・名古屋工業大学・愛知教育大学・名古屋市立大学といった地元国公立大学をはじめ、岐阜大学、三重大学、静岡大学などの東海エリア主要国立大が上位を占めます。
私立大学においても、南山大学や名城大学、中京大学、愛知大学といった地元中堅〜上位私大(愛愛名中)に加え、MARCHや関関同立への進学者をコンスタントに輩出。学校側の手厚い進路補習や進学ガイダンスが機能しており、「一般入試で粘り強く戦う学力」を養成する土壌が整っています。また、難関私立大学の指定校推薦枠も豊富に保持しているものの、国公立志向が強い校風ゆえに一般入試へ挑戦する生徒が多い点も特徴です。